里面核糖体参预位点(IRES)的旨趣、关节和应用
里面核糖体参预位点(internal ribosome entry site,IRES) 是位于mRNA 的5'端非编码区的一段特地序列, 核糖体大略径直伙同这段序列,从而肇始mRNA的翻译。IRES允许盘问东说念主员在并吞入手子的限制下共抒发多个基因。在昔日的几十年中,IRES已被用于诞生数百种转基因模子,并被认为是啮齿动物模子中转基因共抒发的“首选”时刻。
IRES作用机制:靶基因的内源性入手子征战单个mRNA的转录,该mRNA包含认识基因(见下图,蓝色)和荧光阐发基因(见下图,红色)的编码区。阐发基因和认识基因抒发为两种独处的卵白质(非和会),最终使阐发基因保执统统功能。尽可能保留认识基因的内源性抒发。
除了IRES不错共抒发多个基因外,2A肽也有访佛的功能,不知说念2A肽是什么,奈何用2A肽的家东说念主们不错看我往期精彩执行:干货共享|2A肽在病毒学盘问中的应用
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IRES作用机制(图片开始:www.genoway.com)
IRES序列最早是Pelletier等东说念主于1988年脊髓灰质炎病毒 ( poliovirus) 中发现的。当今东说念主们在统统微弱核糖核酸病毒和其他病毒中皆发现了访佛的IRES序列。举例DNA病毒,包括卡波西赘瘤病毒(KSHV)和疱疹病毒液编码IRES序列。除了病毒以为,真核生物的mRNA的5'端非编码区也可能含有IRES序列。当今好多抒发质粒载体上皆有IRES序列。
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IRES的应用:
(1)构建基于多基因的疾病模子
IRES已得胜用于构建模拟多样东说念主类病理的模子。多个cDNA不错在并吞入手子的限制下抒发。这导致这些基因在并吞细胞或组织中共抒发。作家期骗IRES共抒发hAPP和hTau卵白,从而得胜构建了阿尔兹海默病小鼠模子。
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期骗IRES共抒发hAPP和hTau卵白构建阿尔兹海默病小鼠模子(Bettina Platt et al. 2011. PLoS One)
(2)构建阐发基因模子
IRES 可用于在认识基因的 3' UTR 处插入阐发基因。激活后,包含构建 IRES 阐发基因靶基因的 mRNA 被翻译为两个独处的卵白质。
阐发基因使盘问东说念主员大略量化基因抒发水平,追踪抒发运筹帷幄基因的细胞,并监测基因的调控。从历史上看,还是得胜构建了这么的模子,举例,量化调养性T细胞的效应功能,量化细胞因子的产生,在时候上追踪产生细胞因子的细胞,以及可视化感觉神经元中的特定气息受体。
(3)构建细胞谱系追踪模子
在运筹帷幄基因的3' UTR处插入IRES使咱们大略诞生用于细胞谱系追踪的模子。盘问东说念主员不错使用这些模子来盘问和分析给定细胞群的时空细胞运道。
(4)监测KO模子中的细胞抒发方法
IRES系统往常用于KOMP、EUCOMM和NorCOMM等高通量基因纠合敲除诞生的条目性基因敲除小鼠模子。这些系统使盘问东说念主员大略监测多样组织和细胞中的基因抒发方法和基因调控。
(5)生成组织特异性 Cre 驱动细胞系
IRES常常用于生成Knock-in Cre驱动的细胞系。Knock-in关节允许被驱动的细胞系诚恳地响应所选Cre抒发位点的抒发方法。IRES序列保留了靶基因的抒发或允许阐发基因的共抒发。阐发基因不错提供联系Cre重组酶抒发水平或抒发方法的信息。
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